农业公司土地流转需要根据实际情况来确认对应的会计分录，如果是租赁土地，则可以直接计入“预付账款--租赁费”科目，然后按月进行摊销。会计分录：支付时

借：预付账款--租赁费，

贷：现金等每月摊销时，

借：管理费用—租赁费。

如果是获取土地所有权，

则可以计入无形资产—土地。